====== Základní datové okno ======
  * zobrazení různých modalit při opakované stimulaci (např. terčové/časté podněty, emociálně orientovaná stimulace, stisknutí tlačítka)  
  * je-li zvolena volba pro modul **TrialsManager**,FIXME v okně se vždy zobrazí všechny (i arteficiální) trialy, v ostatních případech záleží na volbě parametru //trials.showAllTrials = 0 // v souboru parametrů

{{:zobrazeni:filter-4mods.png?500|}}

  * filtrovaný signál v pásmu (0.1-15)Hz

{{:zobrazeni:filter-scalp_head.png?500|}}
  * filtrovaný signál v pásmu se zobrazenou polohou elektrody na skalpu (0.1-5.5)Hz


//ScopeMat(c)//

{{:zobrazeni:cd2mod.png?500|}}

  * výkon ( výpočet Komplexní demodulace v pásmu 15-19 Hz) 
  * procentuální nárůst vůči baselině (zeleně ohraničená klidová oblast)
  * výkon dvou modalit (target/freqvent)

====== Odečet hodnot vrcholů ======
{{:zobrazeni:peakpar.png?500|}}

====== Statistická významnost ======


//ScopeMat(c)//

{{:zobrazeni:gridwin.png?500|}}

  * statistická významnost modalit (nepárový ttest, Schoffe korekce pro n>2 modality)
  * statistická významnost vůči baselině (tmavá - stat.významné, světlá - stat.nevýznamné)
  * grid
  * volitelné nastavení jemnosti časové osy
  * dvě modality (target/freqvent)

====== Trialy přes sebe ======




{{:zobrazeni:power-trials.png?500|}}
{{:zobrazeni:trial.png?500|}}

  * výkon signálu (3-12 Hz), trialy přes sebe a vybraný trial v samostatném okně

  * zobrazení obecně pro segmentovaná data (výkon: komplexní demodulace, filtrace)
  * oranžová barva - odebrané/vybrané trialy)
  * nezávislé na počtu modalit
  * **označení** trialu kliknutím levým tlačítkem myši
     * zobrazí pořadové číslo trialu  
     * vybraný trial se zobrazí v samostatném okně 
     * průměrný signál (zelená barva) 
  * **odznačení** trialu kliknutím pravým tlačítkem myši
  * odznačení nezvýrazněného trialu má za následek zrušení čáry



====== Kanály přes sebe ======
//ScopeMat(c)//

  * zobrazení průměrných trialů vybrané skupiny kanálů. Červeně statisticky významné oblasti vzhledem k baselině (Wilkoxonův párový test)
  * filtrováno (0.2 -40) Hz
{{:zobrazeni:channs_stats.png?500|}}

  * jeden kanál filtrovaný v různých frekvenčních pásmech, výkon kanálu (zelená)ve frekvenčním pásmu 250-280 Hz  
{{:zobrazeni:trialmulti.png?500|}}   

  * průměry patnácti kanálů filtrovaných v jednom frekvenčním pásmu pro jeden výběr segmentů (set12)
{{:zobrazeni:multisignals.png?800|}}

  * průměry dvou různých filtrovaných kanálů, pro každý kanál několik variant výběru segmentů (set 0,1,2,3,4,12,34)
{{:zobrazeni:multisignalssetsb.png?800|}}

====== Zobrazení a detekce epileptických hrotů ======
 
  * export detekovaných hodnot do textového souboru (poloha, amplituda, typ, průměrná amplituda okolí zobrazeného v okně)
  * funkce pro zobrazení hodnoty "datatip"
{{:zobrazeni:spikesdatatips.png?800|}}

  * zobrazení detekovaných epileptických hrotů a jejich průměr 
{{:zobrazeni:epi-spikesaverage.png?800|}}

Pozn.:

  * nastavení barev pomocí příkazu  [[menu_a_ovladani_programu:menu_a_ovladani_programu|Menu a ovládání programu]]  | SP(cmap)]]
  * nastavení typu a tloušťky čáry pro jednotlivé vlny 


  * detekce parametrů epileptických hrotů 
{{:zobrazeni:spikesdetection.png?800|}} 
     

====== TFA - časově frekvenční analýza ======
//ScopeMat(c)//
  - matice výkonů (//osa y: frekvence 0 až 200Hz, osa x: čas -1 až 2.5s//)
  - matice signifikantních změn
  - matice -log10(p), p je pravděpodobnost změny 

<code>
   ad 2,3) Wilkoxonův test mean(int) vs. mean(BL)
           ERS (červená), ERD (modrá)
           hladina významnosti světlá pro p < 0.05, tmavá pro p < 0.01
</code>   

{{:zobrazeni:tfa-pw.png?250|}}
{{:zobrazeni:tfa-pw_p.png?250|}}
{{:zobrazeni:tfa-p.png?250|}}



====== Boostrap statistika a konfidenční intervaly ======
//ScopeMat(c)//

  * aplikace určená pro výkon signálu vypočtený metodou např. Komplexní demodulace, Hilbertova transformace
  * detekce statisticky významného nárůstu/poklesu výkonu vůči baselině (červená čára)  
  * detekce statisticky významných rozdílů mezi modalitami na základě překryvu konfidenčních intervalů (vyznačeno šedým polem)

{{:zobrazeni:cdbootstrap1.png?500|}}

====== Detekce statisticky významného rozdílu spekter před a po stimulací ======

{{:zobrazeni:statsspectrumdiifbootstrap.png|}} 
  * opakovaná stimulace
  * výpočet spekter v předem specifikovaných časových intervalech 
  * statistické srovnání spektra v daném intervalu vůči spektru v baselině 
  * zobrazení:
     * osa y - časový úsek v ms
     * osa x - frekvence v Hz
     * červená ERD - pokles výkonu, modrá ERS - nárůst výkonu 
  * export do XLS souboru

====== Frekvenční spektrum ======
 
Spectral Estimation Methods

  - Periodogram (Power spectral density estimate)
  - Welch (Averaged periodograms of overlapped, windowed signal sections) 

{{:zobrazeni:spectrumperiodogram.png?300|}}
{{:zobrazeni:spectrumwelch.png?300|}}


====== Detekce maximální a minimální amplitudy ======

//Physioplore(c)//

  * mezi dvěmi kurzory detekuje postupně pro všechny křivky minimum (N2), maximum (P3)
  * v případě opačné polarity je třeba minimalizovat vzdálenost mezi kurzory  
  * jednotlivé křivky se postupně zvýrazní
  * možno definovat počet vrcholů (patrně s m souboru FIXME)

{{:zobrazeni:peak-detect_1.png?800|}}
{{:zobrazeni:peak-detect_2.png?800|}}



//ScopeMat(c)//

  * mezi dvěmi kurzory detekuje postupně pro všechny křivky minimum (N2), maximum (P3), v případě opačné polarity je třeba minimalizovat vzdálenost mezi kurzory  
  * pořadí barev: červená, modrá, zelená  

<code>
function analyzeP300_emoce(file);
volba: peak_detection  = 1;
</code>

{{zobrazeni:peakdetect.png?500|}}
{{zobrazeni:peakdetecttab.png?500|}}

Značení:

====== Detekce latence dle plochy v 50% a 70% amplitudy ======

<code>
function [results , plt] = peakAreaPerc(yData, N2, P3, plt, p);
</code>

{{zobrazeni:latencedleplochy.png?500}}

**Značení:**
  * černý křížek - detekovaná hranice (možnost varianty širšího peaku - detekce až na konci peaku - pravý spodní oblouček) 
  * kolečko - detekovaná latence, dle barvy pro 50% a 70% amplitudy

**Detekované hodnoty:**

{{:zobrazeni:latencedleplochyxls.png|}}
^ Položka ^ Popis ^ 
| Selected | logická proměnná pro výběr a filtrování řádků|
| FileName | jméno zdrojového souboru |
| FilePath | cesta ke zdrojovému souboru |
| StimType | modalita - typ stimulace|
| ChanNum | číslo kanálu |
| ChanName | název kanálu |
| FromCursor | latence označení levý kurzor|
| ToCursor | latence označení pravý kurzor |
| AreaAll | plocha pod křivkou mezi body //FromCursor// a //ToCursor// |
| MaxY | nalezené maximum |
| MaxX | latence maxima v ms|
| 30%LatA | levý bod daný řezem v 30% hodnotě amplitudy MaxY | 
| 30%Latency | latence určená z poloviny prochy 30%Area |
| 30%LatB | pravý bod daný řezem v 30% hodnotě amplitudy MaxY |
| 30%Area | plocha pod křivkou mezi body //30%LatA // a //30%LatB// |
| 50%LatA | levý bod daný řezem v 50% hodnotě amplitudy MaxY |
| 50%Latency | latence určená z poloviny prochy 50%Area |
| 50%LatB | pravý bod daný řezem v 50% hodnotě amplitudy MaxY |
| 50%Area | plocha pod křivkou mezi body //50%LatA // a //50%LatB// |
| ms | jedotky času|
| Date | datum detekce |
| Hist | historie zpracování až po detekci |




====== Zobrazení signifikantních úseků dat pomocí seskupovacího kritéria AREA  ======
//ScopeMat(c)//

  * zobrazení signifikantních úseků ve skupinách souhrně pro různé kontakty přiřazených k sobě pomocí AREA

{{zobrazeni:signifikancedlearea.png?500}}

Značení:
  * čerchovaná svislá čára - střední hodnota reakční doby
  * tečkovaná svislá čára - směrodatná odchylka reakční doby
  * barva červená/modrá - nárůst/pokles výkonu nad určitou realativní mez (30% baseliny)
  * barva černá - statistická významnost mezi dvěmi modalitami? 
  * křížek - poloha těžiště výkonu

====== Export grafiky ======

  * vektorová grafika (emf)
  * bitmap (TIF, bmp, png, ...) FIXME
  * přímý export do MSWord FIXME

{{:zobrazeni:fig_export.png?500|}}