====== Základní datové okno ======
* zobrazení různých modalit při opakované stimulaci (např. terčové/časté podněty, emociálně orientovaná stimulace, stisknutí tlačítka)
* je-li zvolena volba pro modul **TrialsManager**,FIXME v okně se vždy zobrazí všechny (i arteficiální) trialy, v ostatních případech záleží na volbě parametru //trials.showAllTrials = 0 // v souboru parametrů
{{:zobrazeni:filter-4mods.png?500|}}
* filtrovaný signál v pásmu (0.1-15)Hz
{{:zobrazeni:filter-scalp_head.png?500|}}
* filtrovaný signál v pásmu se zobrazenou polohou elektrody na skalpu (0.1-5.5)Hz
//ScopeMat(c)//
{{:zobrazeni:cd2mod.png?500|}}
* výkon ( výpočet Komplexní demodulace v pásmu 15-19 Hz)
* procentuální nárůst vůči baselině (zeleně ohraničená klidová oblast)
* výkon dvou modalit (target/freqvent)
====== Odečet hodnot vrcholů ======
{{:zobrazeni:peakpar.png?500|}}
====== Statistická významnost ======
//ScopeMat(c)//
{{:zobrazeni:gridwin.png?500|}}
* statistická významnost modalit (nepárový ttest, Schoffe korekce pro n>2 modality)
* statistická významnost vůči baselině (tmavá - stat.významné, světlá - stat.nevýznamné)
* grid
* volitelné nastavení jemnosti časové osy
* dvě modality (target/freqvent)
====== Trialy přes sebe ======
{{:zobrazeni:power-trials.png?500|}}
{{:zobrazeni:trial.png?500|}}
* výkon signálu (3-12 Hz), trialy přes sebe a vybraný trial v samostatném okně
* zobrazení obecně pro segmentovaná data (výkon: komplexní demodulace, filtrace)
* oranžová barva - odebrané/vybrané trialy)
* nezávislé na počtu modalit
* **označení** trialu kliknutím levým tlačítkem myši
* zobrazí pořadové číslo trialu
* vybraný trial se zobrazí v samostatném okně
* průměrný signál (zelená barva)
* **odznačení** trialu kliknutím pravým tlačítkem myši
* odznačení nezvýrazněného trialu má za následek zrušení čáry
====== Kanály přes sebe ======
//ScopeMat(c)//
* zobrazení průměrných trialů vybrané skupiny kanálů. Červeně statisticky významné oblasti vzhledem k baselině (Wilkoxonův párový test)
* filtrováno (0.2 -40) Hz
{{:zobrazeni:channs_stats.png?500|}}
* jeden kanál filtrovaný v různých frekvenčních pásmech, výkon kanálu (zelená)ve frekvenčním pásmu 250-280 Hz
{{:zobrazeni:trialmulti.png?500|}}
* průměry patnácti kanálů filtrovaných v jednom frekvenčním pásmu pro jeden výběr segmentů (set12)
{{:zobrazeni:multisignals.png?800|}}
* průměry dvou různých filtrovaných kanálů, pro každý kanál několik variant výběru segmentů (set 0,1,2,3,4,12,34)
{{:zobrazeni:multisignalssetsb.png?800|}}
====== Zobrazení a detekce epileptických hrotů ======
* export detekovaných hodnot do textového souboru (poloha, amplituda, typ, průměrná amplituda okolí zobrazeného v okně)
* funkce pro zobrazení hodnoty "datatip"
{{:zobrazeni:spikesdatatips.png?800|}}
* zobrazení detekovaných epileptických hrotů a jejich průměr
{{:zobrazeni:epi-spikesaverage.png?800|}}
Pozn.:
* nastavení barev pomocí příkazu [[menu_a_ovladani_programu:menu_a_ovladani_programu|Menu a ovládání programu]] | SP(cmap)]]
* nastavení typu a tloušťky čáry pro jednotlivé vlny
* detekce parametrů epileptických hrotů
{{:zobrazeni:spikesdetection.png?800|}}
====== TFA - časově frekvenční analýza ======
//ScopeMat(c)//
- matice výkonů (//osa y: frekvence 0 až 200Hz, osa x: čas -1 až 2.5s//)
- matice signifikantních změn
- matice -log10(p), p je pravděpodobnost změny
ad 2,3) Wilkoxonův test mean(int) vs. mean(BL)
ERS (červená), ERD (modrá)
hladina významnosti světlá pro p < 0.05, tmavá pro p < 0.01
{{:zobrazeni:tfa-pw.png?250|}}
{{:zobrazeni:tfa-pw_p.png?250|}}
{{:zobrazeni:tfa-p.png?250|}}
====== Boostrap statistika a konfidenční intervaly ======
//ScopeMat(c)//
* aplikace určená pro výkon signálu vypočtený metodou např. Komplexní demodulace, Hilbertova transformace
* detekce statisticky významného nárůstu/poklesu výkonu vůči baselině (červená čára)
* detekce statisticky významných rozdílů mezi modalitami na základě překryvu konfidenčních intervalů (vyznačeno šedým polem)
{{:zobrazeni:cdbootstrap1.png?500|}}
====== Detekce statisticky významného rozdílu spekter před a po stimulací ======
{{:zobrazeni:statsspectrumdiifbootstrap.png|}}
* opakovaná stimulace
* výpočet spekter v předem specifikovaných časových intervalech
* statistické srovnání spektra v daném intervalu vůči spektru v baselině
* zobrazení:
* osa y - časový úsek v ms
* osa x - frekvence v Hz
* červená ERD - pokles výkonu, modrá ERS - nárůst výkonu
* export do XLS souboru
====== Frekvenční spektrum ======
Spectral Estimation Methods
- Periodogram (Power spectral density estimate)
- Welch (Averaged periodograms of overlapped, windowed signal sections)
{{:zobrazeni:spectrumperiodogram.png?300|}}
{{:zobrazeni:spectrumwelch.png?300|}}
====== Detekce maximální a minimální amplitudy ======
//Physioplore(c)//
* mezi dvěmi kurzory detekuje postupně pro všechny křivky minimum (N2), maximum (P3)
* v případě opačné polarity je třeba minimalizovat vzdálenost mezi kurzory
* jednotlivé křivky se postupně zvýrazní
* možno definovat počet vrcholů (patrně s m souboru FIXME)
{{:zobrazeni:peak-detect_1.png?800|}}
{{:zobrazeni:peak-detect_2.png?800|}}
//ScopeMat(c)//
* mezi dvěmi kurzory detekuje postupně pro všechny křivky minimum (N2), maximum (P3), v případě opačné polarity je třeba minimalizovat vzdálenost mezi kurzory
* pořadí barev: červená, modrá, zelená
function analyzeP300_emoce(file);
volba: peak_detection = 1;
{{zobrazeni:peakdetect.png?500|}}
{{zobrazeni:peakdetecttab.png?500|}}
Značení:
====== Detekce latence dle plochy v 50% a 70% amplitudy ======
function [results , plt] = peakAreaPerc(yData, N2, P3, plt, p);
{{zobrazeni:latencedleplochy.png?500}}
**Značení:**
* černý křížek - detekovaná hranice (možnost varianty širšího peaku - detekce až na konci peaku - pravý spodní oblouček)
* kolečko - detekovaná latence, dle barvy pro 50% a 70% amplitudy
**Detekované hodnoty:**
{{:zobrazeni:latencedleplochyxls.png|}}
^ Položka ^ Popis ^
| Selected | logická proměnná pro výběr a filtrování řádků|
| FileName | jméno zdrojového souboru |
| FilePath | cesta ke zdrojovému souboru |
| StimType | modalita - typ stimulace|
| ChanNum | číslo kanálu |
| ChanName | název kanálu |
| FromCursor | latence označení levý kurzor|
| ToCursor | latence označení pravý kurzor |
| AreaAll | plocha pod křivkou mezi body //FromCursor// a //ToCursor// |
| MaxY | nalezené maximum |
| MaxX | latence maxima v ms|
| 30%LatA | levý bod daný řezem v 30% hodnotě amplitudy MaxY |
| 30%Latency | latence určená z poloviny prochy 30%Area |
| 30%LatB | pravý bod daný řezem v 30% hodnotě amplitudy MaxY |
| 30%Area | plocha pod křivkou mezi body //30%LatA // a //30%LatB// |
| 50%LatA | levý bod daný řezem v 50% hodnotě amplitudy MaxY |
| 50%Latency | latence určená z poloviny prochy 50%Area |
| 50%LatB | pravý bod daný řezem v 50% hodnotě amplitudy MaxY |
| 50%Area | plocha pod křivkou mezi body //50%LatA // a //50%LatB// |
| ms | jedotky času|
| Date | datum detekce |
| Hist | historie zpracování až po detekci |
====== Zobrazení signifikantních úseků dat pomocí seskupovacího kritéria AREA ======
//ScopeMat(c)//
* zobrazení signifikantních úseků ve skupinách souhrně pro různé kontakty přiřazených k sobě pomocí AREA
{{zobrazeni:signifikancedlearea.png?500}}
Značení:
* čerchovaná svislá čára - střední hodnota reakční doby
* tečkovaná svislá čára - směrodatná odchylka reakční doby
* barva červená/modrá - nárůst/pokles výkonu nad určitou realativní mez (30% baseliny)
* barva černá - statistická významnost mezi dvěmi modalitami?
* křížek - poloha těžiště výkonu
====== Export grafiky ======
* vektorová grafika (emf)
* bitmap (TIF, bmp, png, ...) FIXME
* přímý export do MSWord FIXME
{{:zobrazeni:fig_export.png?500|}}