Dělení příkazů:
Příkaz | Funkce | Parametry | Implementace | Poznámka | Dat.zm. |
---|---|---|---|---|---|
AVG([-3 5 1 2 4], 'mean,std,median,selected'); | průměr pro jednu i více modalit | -3 5 zobrazení před a po stimulu v sec; 1 2 4 jsou vybrané modality v pořadí segmentace (např. 1-TG, 2-FQ, 3-dis 4-Reakce ), selected počítá poue s vybranými trialy definovanými v HDF souboru, varianta je tlačítko Select Trials | neúplné segmenty do průměru nejdou | průměr pro velká data, lze i median (nutno ale počítat po bodech) | |
cutter('ripp'); | katr | parametrický soubor /export/*ripp.txt | rozdělí kanál na intervaly, na kterých lze počítat statistiku, kousky mohou byt ruzne dlouhe, jsou dané tabulkou ripp | naseka data | 1.9.2016 |
clearsig('PD2,min,0.57,std,40,fig'); | čistí signál např. od artefaktů | fig pro vykreslení okna | pro křivku PD2,pro val < minimální hodnota a val > std* koef nahradí za NaN | 5.4.2017 | |
filtr(0,40); | FFT filtr | od - do Hz | 10/10/10 | ||
FW([fwSize]); | vzhlazení dat plovoucím oknem | fwSize velikost plovoucího okna v sekundách | použije-li se funkce před AVG - vyhladí se celá data, použije-li se po AVG, vyhladí se pouze zprůměrovaná křivka AVG.mean | 18.6.2013 | |
info(); | |||||
info('subject'); | |||||
info('group'); | |||||
info('spectrum',[]); | |||||
info('rippfile'); | |||||
info('ripped,0,group'); | počítá statistiku z intervalů | 0…?, group je výstup do společného statistického souboru | |||
norm('metoda1'); | normalize zprůměrněných dat v okně | BL - posun na nulu o hodnotu mean(baseliny), BLpct - procentuální přepočet vzhledem k baselině | řadí se po PD | 05/04/13 | |
norm('metoda2'); | normalize zprůměrněných dat v datové struktuře i bez PD | BL0 - posun na nulu o hodnotu mean(baseliny), BLpct0 - procentuální přepočet vzhledem k baselině | řadí se před PD | 05/04/13 | |
PD('trials'); | vykreslí průměr a všechny trialy připravené ke zprůměrnění | segmentovaná data předchází-li někde příkaz AVG, který vytvoří stejnojmenné pole data.AVG, 'trials' segmenty přes sebe / nesegmentovaná data; | 10/10/10 | ||
PD('r'); | viz. výše | 'r' RGB definice barev | 10/10/10 | ||
PD([0 1 0]); | viz. výše | [0 1 0] RGB definice barev | 10/10/10 | ||
PD(); | standardní nastavení | ostatní viz. výše | 10/10/10 | ||
PSD(); | Power Spectral Density | periodogram | funkce psd | 20/11/13 | |
power(0,40); | komplexní demodulace | od - do Hz | 10/10/10 | ||
SAVEch('format,filter/0-40/'); | ulož kanál do HDF | hdf5, mat, mat1ch | 10/10/10 | ||
shiftch(param) | přeskládání trialů do 2D matice trialy x čas | all/noArtefacts | |||
sjednotit s postupem: | resample(200);AVG([-2.1 7.1]);remtrend('data');filtr(0.1,5.5);AVG([-2.1 7.1],'update');PD();PD('trials'); | ||||
spikes('A',[t1,t2, n],'spike1,Up'); | detekce hrotů po trialech | 'A'/'M' automatická/manuální detekce, [t1,t2,n], t1/t2- čas počátku/konce detekce vztažený k trigeru, n počet oblouků nad a pod nulou], spike1 název údálosti, 'Up'/'Dn' detekce horních/dolních oblouků, bez uvedení jsou detekovány obě varianty Up+Dn | data jsou normalizována odečtem baseliny, časové údaje v sekundách | 29/09/12 | |
statsman('Auto/Manual',[from to],'text'); | stanovení latencí na základě výpočtu plochy pod křivkou v 50% a 70% maxima/minima | A automatic/M manual, detekovaný interval, název adresáře pro uložení | 04/04/13 | ||
TFAsegm([freqMin freqMax -tMin tMax],'fw,FWS'); | časově frekvenční analýza | freqMin dolní frekvence, freqMax horní frekvence, tMin počáteční čas, tMax konečný čas, fw vyhlazení každé obálky ve frekvenčním posunu plovoucím oknem před zprůměrněním (fce. Average), FWS velikost plovoucího okna | Hilbertova transformace, frekvenční skok 4 Hz, posun 1 Hz | paralelní výpočet, údaje v sekundách | 15/5/2013 |
TFAch(filterFrom,filterTo) | spektrogram | ||||
trials([-t1 t2]); | seskládá trialy do 2D matice | časový rozsah [-t1 t2] sec., t1,t2 vztažené k trigeru | časové údaje v sekundách | 29/09/12 |
Příkaz | Funkce | Parametry | Implementace | Poznámka | Dat.zm. |
---|---|---|---|---|---|
EX(w); | export dat | w - Scopewin, formát: nesegmentovaný | export pouze nearteficiálních segmentů, exp. pouze všech kanálů, chybějící jsou vynechány | pokud nestačí data pak prodlopužení nulami nastane pouze pro poslední 2 segmenty | 28/03/11 |
EX(SignalPlant); | export dat | SignalPlant | hdf2signalplant, v hdf nutno ručně zeditovat Info:Units | formát souboru hdf5 | 1.11.2016 |
EXAVG([t1 t2]); | export trialů v danem intervalu po stimulaci | t1,t2 v sekundách | následuje až po funkci AVG(); | ||
file2HDF5(); | data a parametry do HDF5 | 10/10/10 | |||
InputWizard | selekce dat | součást file2HDF | pouze pro Psylab | 11.4.2016 | |
report(directory1 <directory2>,[]) | vytvoří tex soubory | subjekt/directory, ze kterého se berou všechny podadresáře | directory2 - dvojice adresářů ke srovnání, bere všechny podadresáře | 7/01/16 | |
SEGM([500 10 2000 3000 1540 1555],[TG nonTG dis]); | segmentace dle trigerů | [min.detekční úroveň,délka trigeru v bodech, dolní mez 1, horní mez 1, dm2, hm2,… ] | funkční pouze pokud je šířka trigeru jeden bod | 10/10/10 | |
SEGMsel(Foto,[8 3 1 1]); | nalezne číslo trigrovacího kanálu podle jeho názvu | název kanálu, např. 'Foto' | 10/10/10 |
Příkaz | Funkce | Parametry | Implementace | Poznámka | Dat.zm. |
---|---|---|---|---|---|
{ | otevírá skupinu příkazů | ve sloupci s názvem souboru | 15/03/11 | ||
} | uzavírá skupinu příkazů | ve sloupci s názvem souboru | 15/03/11 | ||
FD | vyvolá File Dialog | ve sloupci s názvem souboru | 24/6/11 | ||
mark(n, type,half); | manuální značkování dat různými typy markerů | n - počet detekovaných bodů nebo [] až po ukončení enterem | 24/6/11 | ||
montages('action,new'); | montage([1:12 14:15 17:18],mean,mean/ch0); | vynechané kontakty, typ montáže, cesta pro uložení např. průměru | nedoděláno | ||
SP(win,on); | zapnutí zápisu do jednoho okna, vše následující se vykreslí do jednoho okna | 15/03/11 | |||
SP(win,off); | vypnutí zápisu do jednoho okna, následující křivka bude vykreslena do samostatného okna | 15/03/11 | |||
SP(cmap,par);SP(cmap); | nastavení pořadí barev při vykreslení více křivek | nic=default, … | colorMap | 5/4/2011 | |
SP(wingrid,par); | zobrazení x,y gridu | par: on/off | 27/9/2013 | ||
SP(FDRinTime, [compute time1 time2]); | FDR korekce počítaná pro p(t1-t2) | [ano/ne, čas1 - čas2] | |||
SP(ylim,[ampl1 ampl2]); | nastavení rozsahu osy y | [] = automat, … | 1.11.2016 |
InputWizard
Vykreslení variant (setX) zpracování pro každý kanál zvlášť (1-4) do jednoho okna (způsob zápisu, výsledek) :
Vykreslení více kanálů (1-4) pro set34 do jednoho okna (způsob zápisu, výsledek):
Vykreslení vybraného kanálu z více souborů do jednoho okna (způsob zápisu, výsledek):
RGB Value | Short Name | Long Name |
---|---|---|
[1 1 0] | y | yellow |
[1 0 1] | m | magenta |
[0 1 1] | c | cyan |
[1 0 0] | r | red |
[0 1 0] | g | green |
[0 0 1] | b | blue |
[1 1 1] | w | white |
[0 0 0] | k | black |