Makro jazyk

Dělení příkazů:

Funkce kanálnické

Příkaz Funkce Parametry Implementace Poznámka Dat.zm.
AVG([-3 5 1 2 4], 'mean,std,median,selected'); průměr pro jednu i více modalit -3 5 zobrazení před a po stimulu v sec; 1 2 4 jsou vybrané modality v pořadí segmentace (např. 1-TG, 2-FQ, 3-dis 4-Reakce ), selected počítá poue s vybranými trialy definovanými v HDF souboru, varianta je tlačítko Select Trials neúplné segmenty do průměru nejdou průměr pro velká data, lze i median (nutno ale počítat po bodech)
cutter('ripp'); katr parametrický soubor /export/*ripp.txt rozdělí kanál na intervaly, na kterých lze počítat statistiku, kousky mohou byt ruzne dlouhe, jsou dané tabulkou ripp naseka data 1.9.2016
clearsig('PD2,min,0.57,std,40,fig'); čistí signál např. od artefaktů fig pro vykreslení okna pro křivku PD2,pro val < minimální hodnota a val > std* koef nahradí za NaN 5.4.2017
filtr(0,40);FFT filtr od - do Hz 10/10/10
FW([fwSize]); vzhlazení dat plovoucím oknem fwSize velikost plovoucího okna v sekundách použije-li se funkce před AVG - vyhladí se celá data, použije-li se po AVG, vyhladí se pouze zprůměrovaná křivka AVG.mean 18.6.2013
info();
info('subject');
info('group');
info('spectrum',[]);
info('rippfile');
info('ripped,0,group'); počítá statistiku z intervalů 0…FIXME?, group je výstup do společného statistického souboru
norm('metoda1');normalize zprůměrněných dat v okně BL - posun na nulu o hodnotu mean(baseliny), BLpct - procentuální přepočet vzhledem k baselině řadí se po PD 05/04/13
norm('metoda2');normalize zprůměrněných dat v datové struktuře i bez PD BL0 - posun na nulu o hodnotu mean(baseliny), BLpct0 - procentuální přepočet vzhledem k baselině řadí se před PD 05/04/13
PD('trials'); vykreslí průměr a všechny trialy připravené ke zprůměrnění segmentovaná data předchází-li někde příkaz AVG, který vytvoří stejnojmenné pole data.AVG, 'trials' segmenty přes sebe / nesegmentovaná data; 10/10/10
PD('r'); viz. výše 'r' RGB definice barev 10/10/10
PD([0 1 0]); viz. výše [0 1 0] RGB definice barev 10/10/10
PD(); standardní nastavení ostatní viz. výše 10/10/10
PSD(); Power Spectral Density periodogram funkce psd 20/11/13
power(0,40); komplexní demodulace od - do Hz 10/10/10
SAVEch('format,filter/0-40/'); ulož kanál do HDF hdf5, mat, mat1ch 10/10/10
shiftch(param) přeskládání trialů do 2D matice trialy x čas all/noArtefacts
sjednotit s postupem: resample(200);AVG([-2.1 7.1]);remtrend('data');filtr(0.1,5.5);AVG([-2.1 7.1],'update');PD();PD('trials');
spikes('A',[t1,t2, n],'spike1,Up'); detekce hrotů po trialech 'A'/'M' automatická/manuální detekce, [t1,t2,n], t1/t2- čas počátku/konce detekce vztažený k trigeru, n počet oblouků nad a pod nulou], spike1 název údálosti, 'Up'/'Dn' detekce horních/dolních oblouků, bez uvedení jsou detekovány obě varianty Up+Dn data jsou normalizována odečtem baseliny, časové údaje v sekundách 29/09/12
statsman('Auto/Manual',[from to],'text'); stanovení latencí na základě výpočtu plochy pod křivkou v 50% a 70% maxima/minima A automatic/M manual, detekovaný interval, název adresáře pro uložení FIXME 04/04/13
TFAsegm([freqMin freqMax -tMin tMax],'fw,FWS'); časově frekvenční analýza freqMin dolní frekvence, freqMax horní frekvence, tMin počáteční čas, tMax konečný čas, fw vyhlazení každé obálky ve frekvenčním posunu plovoucím oknem před zprůměrněním (fce. Average), FWS velikost plovoucího okna Hilbertova transformace, frekvenční skok 4 Hz, posun 1 Hz paralelní výpočet, údaje v sekundách 15/5/2013
TFAch(filterFrom,filterTo)spektrogram
trials([-t1 t2]); seskládá trialy do 2D matice časový rozsah [-t1 t2] sec., t1,t2 vztažené k trigeru časové údaje v sekundách 29/09/12

Funkce jednorázové

Příkaz Funkce Parametry Implementace Poznámka Dat.zm.
EX(w); export dat w - Scopewin, formát: nesegmentovaný export pouze nearteficiálních segmentů, exp. pouze všech kanálů, chybějící jsou vynechány FIXME pokud nestačí data pak prodlopužení nulami nastane pouze pro poslední 2 segmenty FIXME28/03/11
EX(SignalPlant); export dat SignalPlant hdf2signalplant, FIXME v hdf nutno ručně zeditovat Info:Units formát souboru hdf5 1.11.2016
EXAVG([t1 t2]); export trialů v danem intervalu po stimulaci t1,t2 v sekundách následuje až po funkci AVG();
file2HDF5(); data a parametry do HDF5 10/10/10
InputWizard selekce dat součást file2HDF pouze pro Psylab 11.4.2016
report(directory1 <directory2>,[]) vytvoří tex soubory subjekt/directory, ze kterého se berou všechny podadresáře directory2 - dvojice adresářů ke srovnání, bere všechny podadresáře 7/01/16
SEGM([500 10 2000 3000 1540 1555],[TG nonTG dis]); segmentace dle trigerů [min.detekční úroveň,délka trigeru v bodech, dolní mez 1, horní mez 1, dm2, hm2,… ] funkční pouze pokud je šířka trigeru jeden bod 10/10/10
SEGMsel(Foto,[8 3 1 1]); nalezne číslo trigrovacího kanálu podle jeho názvu název kanálu, např. 'Foto' 10/10/10

RGB definice barev

Funkce obslužné

Příkaz Funkce Parametry Implementace Poznámka Dat.zm.
{ otevírá skupinu příkazů ve sloupci s názvem souboru 15/03/11
} uzavírá skupinu příkazů ve sloupci s názvem souboru 15/03/11
FD vyvolá File Dialog ve sloupci s názvem souboru 24/6/11
mark(n, type,half); manuální značkování dat různými typy markerů n - počet detekovaných bodů nebo [] až po ukončení enterem 24/6/11
montages('action,new'); montage([1:12 14:15 17:18],mean,mean/ch0); vynechané kontakty, typ montáže, cesta pro uložení např. průměru nedoděláno FIXME
SP(win,on); zapnutí zápisu do jednoho okna, vše následující se vykreslí do jednoho okna 15/03/11
SP(win,off); vypnutí zápisu do jednoho okna, následující křivka bude vykreslena do samostatného okna 15/03/11
SP(cmap,par);SP(cmap); nastavení pořadí barev při vykreslení více křivek nic=default, … colorMap 5/4/2011
SP(wingrid,par); zobrazení x,y gridu par: on/off 27/9/2013
SP(FDRinTime, [compute time1 time2]); FDR korekce počítaná pro p(t1-t2) [ano/ne, čas1 - čas2]
SP(ylim,[ampl1 ampl2]); nastavení rozsahu osy y [] = automat, … 1.11.2016

Příklady

InputWizard

InputWizard

Vykreslení variant (setX) zpracování pro každý kanál zvlášť (1-4) do jednoho okna (způsob zápisu, výsledek) :

Vykreslení více kanálů (1-4) pro set34 do jednoho okna (způsob zápisu, výsledek):

Vykreslení vybraného kanálu z více souborů do jednoho okna (způsob zápisu, výsledek):

Definice barev

RGB Value Short Name Long Name
[1 1 0] y yellow
[1 0 1] m magenta
[0 1 1] c cyan
[1 0 0] r red
[0 1 0] g green
[0 0 1] b blue
[1 1 1] w white
[0 0 0] k black