Makro jazyk

Dělení příkazů:

Funkce kanálnické

Příkaz Funkce Parametry Implementace Poznámka
AVG([-3 5 1 2 4], 'mean,std,median,selected'); průměr pro jednu i více modalit -3 5 zobrazení před a po stimulu v sec; 1 2 4 jsou vybrané modality v pořadí segmentace (např. 1-TG, 2-FQ, 3-dis 4-Reakce ), selected počítá poue s vybranými trialy definovanými v HDF souboru, varianta je tlačítko Select Trials neúplné segmenty do průměru nejdou průměr pro velká data, lze i median (nutno ale počítat po bodech)
DEC(64); decimace konečná vzorkovací frekvence DOPLNIT kontrolu ztráty úzkých trigerů
filtr(0,40);FFT filtr od - do Hz OK
PD('trials'); vykreslí průměr/celý jeden kanál segmentovaná data předchází-li někde příkaz AVG, který vytvoří stejnojmenné pole data.AVG, 'trials' segmenty přes sebe / nesegmentovaná data;
PD('r'); viz. výše 'r' RGB definice barev
PD([0 1 0]); viz. výše [0 1 0] RGB definice barev
PD(); standardní nastavení ostatní viz. výše
PDS(['periodogram,Blackman']); spektrum signálu váhovaného oknem definice váhovacích oken, metody pro odhad spektra
power(0,40); komplexní demodulace od - do Hz OK
SAVE('filter/0-40/'); ulož do HDF OK - vždy zapisovat dvě úrovně
shiftCH('segments'); manipulace s datovým kanálem 'segments' - sestaví jednotlivé segmenty za sebou do jedné časové řady, bez artefaktů, bez neúplných segmentů, délka segmentu a poloha trigeru jsou dány předchozím příkazem AVG příkazu musí předcházet AVG, který vytvoří indexy segmentů
shiftCH('segments,all'); manipulace s datovým kanálem 'segments' - viz výše, zahrnuje všechny trialy včetně artefaktů a neúplných segmentů - ty jsou doplněny nulami příkazu musí předcházet AVG, který vytvoří indexy segmentů

Funkce jednorázové

Příkaz Funkce Parametry Implementace Poznámka
EX(w); export dat w - Scopewin, formát: nesegmentovaný export pouze všech kanálů, chybějící jsou vynechány FIXME OK
file2HDF5(); data a parametry do HDF5 OK
h5repack(); přealokuje a zkomprimuje HDF5 soubor ve FileList a sloupci A je vhodné nastavovat 100
SEGM([500 10 2000 3000 1540 1555],[TG nonTG dis]); segmentace dle trigerů [min.detekční úroveň,délka trigeru v bodech, dolní mez 1, horní mez 1, dm2, hm2,… ] - pokud je velikost trigeru jeden bod - 0 digitální triger - OK - pokud je délka trigeru větší než jeden bod, je třeba upravit databin a nastávají tyto možnosti: 1 - bere se první bod, 2 - bere se maximum mezi prvním a posledním bodem, 3 - bere se průsečík s nástupnou hranou v předepsané hladině)) 0 - OK; 1,2,3 není hotovo
SEGMsel(stimuly,[8 3 1 1]); výběr trigrovacího kanálunázev kanálu
song(); zapět song OK
PRN('on') automatický tisk 'on'/ 'off' automaticky se vypne po posledním příkazu na řádku
remtrend(); odtranění trendu (spádu a stejnosměrné složky) lineání metoda

Funkce obslužné

Příkaz Funkce Parametry Implementace Poznámka
{ ve sloupci s názvem souboru otevírá skupinu příkazů
} ve sloupci s názvem souboru uzavírá skupinu příkazů
SP(baseline,[0.6 0.05]); baselina umístění před trigrovací značkou 07/01/16
SP(FDRinTime,[ compute t1 t2]); FDR korekce FDR pro x časových bodů za sebou v daném intervalu compute = 1/0, t1,t2 v sekundách 07/01/16
SP(nextTrigLines,[x1 x2 … xn]); svislá čára označení časových úseků 07/01/16
SP(win,on); zapnutí zápisu do jednoho okna, vše následující se vykreslí do jednoho okna
SP(win,off); vypnutí zápisu do jednoho okna, následující křivka bude vykreslena do samostatného okna automaticky spouští SP(cmap), lze předem vypnout SP(cmap,off)
SP(cmap,par);SP(cmap); nastavení pořadí barev při vykreslení více křivek nic=default, off/on=ne/bude použito v aut. modu, … colorMap

Příklady

Vykreslení variant (setX) zpracování pro každý kanál zvlášť (1-4) do jednoho okna (způsob zápisu, výsledek):

Vykreslení více kanálů (1-4) pro set34 do jednoho okna (způsob zápisu, výsledek):

Vykreslení vybraného kanálu z více souborů do jednoho okna (způsob zápisu, výsledek):

Low Level funkce

Funkce Parametry Typ Poznámka Kontrola
HDF52scopewin (filepath, filename, command) Uloží libovolné kanály do Scopewinu Zobecnit hledání v HDF5 a uložit samostatně - obecné řešení

Definice barev

RGB Value Short Name Long Name
[1 1 0] y yellow
[1 0 1] m magenta
[0 1 1] c cyan
[1 0 0] r red
[0 1 0] g green
[0 0 1] b blue
[1 1 1] w white
[0 0 0] k black

Definice váhovacích oken

Spectral Estimation Methods

Method Command Description spectrum.estmethod Corresponding Function
Periodogram periodogram Power spectral density estimate spectrum.periodogram periodogram
Welch welch Averaged periodograms of overlapped, windowed signal sections spectrum.welch pwelch
Burg - Autoregressive (AR) spectral estimation of a time-series by minimization of linear prediction errors spectrum.burg pburg
Covariance cov Autoregressive (AR) spectral estimation of a time-series by minimization of the forward prediction errors spectrum.cov pcov
Modified Covariance mcov Autoregressive (AR) spectral estimation of a time-series by minimization of the forward and backward prediction errors spectrum.mcov pmcov
Eigenvector - Pseudospectrum estimate spectrum.eigenvector peig
Thompson multitaper mtm Spectral estimate from combination of multiple orthogonal windows (or “tapers”) spectrum.mtm pmtm
MUSIC Multiple Signal Classification spectrum.music pmusic
Yule-Walker AR - Autoregressive (AR) spectral estimate of a time-series from its estimated autocorrelation function spectrum.yulear pyulear